Real-time PCR:Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知樣品進行定量測定,因此,實時熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的、值得信賴的科學(xué)方法。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實時熒光定量PCR是迄今為止定量較準(zhǔn)確,重現(xiàn)性較好的定量方法,已得到全世界的公認,普遍用于基因表達研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。實時熒光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有兩種策略,相對定量和定量。PCR可能是分子生物學(xué)中使用很較廣的技術(shù)。臺州組織定量PCR
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗污染:PCR反應(yīng)的很大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人腦袋不適的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產(chǎn)生。污染原因:標(biāo)本間交叉污染:標(biāo)本污染主要有收集標(biāo)本的容器被污染,或標(biāo)本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標(biāo)本而造成相互間交叉污染;標(biāo)本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導(dǎo)致彼此間的污染。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置。臺州組織定量PCRReal-time PCR探針法實驗結(jié)果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)生物學(xué)研究的歷史中占據(jù)了重要的地位。以此為基礎(chǔ)發(fā)展出包括Real-time PCR在內(nèi)的多項應(yīng)用技術(shù)。自誕生后Real-time PCR技術(shù)持續(xù)發(fā)展,從簡單的增擴到整個PCR過程,Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個循環(huán)增擴曲線的增長。事實并非如此,早期的軟件不能在運行期間提供可視化的增擴曲線。主要是因為SDS軟件采用整個平臺較終的數(shù)據(jù)執(zhí)行數(shù)據(jù)分析工作,而不是分析每個單獨的反應(yīng)循環(huán)。對某些設(shè)備來說,必須向分析軟件提供實時的數(shù)據(jù),有些設(shè)備則不需要。前一種設(shè)備允許軟件實時跟蹤每個加樣口的增擴曲線,同時顯示在電腦屏幕上。
Real-time PCR相對定量中的標(biāo)準(zhǔn)曲線法如何進行:主要是相對定量標(biāo)準(zhǔn)品的制作,一般有三種方法:1、比較復(fù)雜的方法:質(zhì)粒,采用Biotnt提供內(nèi)參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物,對目的基因進行Real-time PCR實驗,得到PCR擴增產(chǎn)物;PCR擴增產(chǎn)物轉(zhuǎn)入質(zhì)粒中,得到相對定量的標(biāo)準(zhǔn)品;2、一般采用的方法1:比較強的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR擴增產(chǎn)物,如果在方法2中找不到比較強的CDNA模板,則選用PCR產(chǎn)物作為相對定量的標(biāo)準(zhǔn)品也是可以的;需要注意的事項是:PCR產(chǎn)物濃度很高,而Real-time PCR的產(chǎn)物片段比較短,容易在稀釋的過程中造成PCR污染,要注意操作。嵌套聚合酶鏈反應(yīng)的兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR。
Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的特點:靈敏度高:PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴增到微克(μg=-6)水平。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位);在細菌學(xué)中很小檢出率為3個細菌。簡便、快速:PCR反應(yīng)用耐高溫的TaqDNA聚合酶,一次性地將反應(yīng)液加好后,即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性-退火-延伸反應(yīng),一般在2~4小時完成擴增反應(yīng)。擴增產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。純度要求低:不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,DNA粗制品及RNA均可作為擴增模板??芍苯佑门R床標(biāo)本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活組織等DNA擴增檢測。武漢微量Real-time PCR供應(yīng)商聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中?,F(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成。無錫骨頭RT-PCR檢測技術(shù)應(yīng)用
PCR反應(yīng)的很大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性。臺州組織定量PCR
Real-time PCR鏈反應(yīng)注意事項:在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴增,必須設(shè)陰性對照;內(nèi)參的設(shè)定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進入平臺期,出現(xiàn)平臺效應(yīng)與所擴增的目的基因的長度、序列、二級結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān)。故對于每一個目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺效應(yīng)的循環(huán)數(shù),均應(yīng)通過單獨實驗來確定;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA;在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。臺州組織定量PCR
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