Real-time PCR與普通PCR的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟煌?,所以?duì)引物的設(shè)計(jì)要求也不同。普通PCR的實(shí)驗(yàn)?zāi)康闹皇菫榱双@得目的基因產(chǎn)物,允許有非特異擴(kuò)增,只要目標(biāo)條帶清晰明亮,就可以通過(guò)切膠回收的方法回收目標(biāo)條帶,之后進(jìn)行后續(xù)的克隆、測(cè)序。但Real-time PCR的目的是為了讓目的基因按照理論值或是按照接近理論值進(jìn)行擴(kuò)增,只有這樣的擴(kuò)增后續(xù)由Ct值推算出的起始量模板量才準(zhǔn)確,基于此,Real-time PCR對(duì)非特異性擴(kuò)增和引物二聚體的存在有較嚴(yán)格的要求。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中的DMSO、甘油等,主要用來(lái)保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。徐州血液定量PCR供應(yīng)商
所謂real-timeQ-PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒光信號(hào)累積實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,之后通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。在real-time技術(shù)的發(fā)展過(guò)程中,兩個(gè)重要的發(fā)現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn),它能降解特異性熒光記探針,因此使得間接的檢測(cè)PCR產(chǎn)物成為可能。(2)此后熒光雙標(biāo)記探針的運(yùn)用使在一密閉的反應(yīng)管中能實(shí)時(shí)地監(jiān)測(cè)反應(yīng)全過(guò)程。這兩個(gè)發(fā)現(xiàn)的結(jié)合以及相應(yīng)的儀器和試劑的商品化發(fā)展導(dǎo)致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的運(yùn)用。珠海特殊樣本PCR檢測(cè)技術(shù)網(wǎng)站Real-time PCR反是一項(xiàng)利用DNA雙鏈復(fù)制的原理。
Real-time PCR螢光染料摻入法:在PCR反應(yīng)體系中,加入過(guò)量SYBR螢光染料,SYBR螢光染料特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,發(fā)射螢光信號(hào),而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會(huì)發(fā)射任何螢光信號(hào),從而保證螢光信號(hào)的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。此方法適用于:1、靈敏度高:使用SYBR可使螢光效果增強(qiáng)到1000倍以上。2、通用性好,不需要設(shè)計(jì)探針,方法簡(jiǎn)便,省時(shí),價(jià)格低廉。3、通用型方法,在國(guó)內(nèi)外科研中普遍使用。4、高通量大規(guī)模的定量PCR檢測(cè)。5、專一性要求不高的定量PCR檢測(cè)。
Real-time PCR探針?lè)ㄟm用于:1、具有高適應(yīng)性和可靠性,實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。2、適用于擴(kuò)增序列專一的體系的檢測(cè)。3、樣品中靶基因含量過(guò)低的定量PCR檢測(cè)。4、靶基因的特異序列較短,無(wú)論怎樣較佳化引物設(shè)計(jì)條件都不能解決。5、存在與靶基因同源的序列,在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,對(duì)特異性要求較高的定量。6、普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動(dòng)物病原體基因的檢測(cè),畜禽產(chǎn)品的檢驗(yàn)檢疫,生物製品的鑒定。Real-time PCR探針?lè)?PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的螢光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告螢光基團(tuán)和一個(gè)淬滅螢光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的螢光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告螢光基團(tuán)和淬滅螢光基團(tuán)分離,從而螢光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到螢光信號(hào),即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)螢光分子形成,實(shí)現(xiàn)了螢光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。Real-time PCR利用螢光信號(hào)累積實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程。
Real-time PCR鏈反應(yīng)注意事項(xiàng):在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過(guò)程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對(duì)照;內(nèi)參的設(shè)定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動(dòng)蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進(jìn)入平臺(tái)期,出現(xiàn)平臺(tái)效應(yīng)與所擴(kuò)增的目的基因的長(zhǎng)度、序列、二級(jí)結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān)。故對(duì)于每一個(gè)目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺(tái)效應(yīng)的循環(huán)數(shù),均應(yīng)通過(guò)單獨(dú)實(shí)驗(yàn)來(lái)確定;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA;在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。徐州血液定量PCR供應(yīng)商
所謂實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán)。徐州血液定量PCR供應(yīng)商
Real-time PCR原理:Real-time PCR主要指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光物質(zhì),然后通過(guò)熒光化學(xué)物質(zhì)監(jiān)測(cè)每次PCR反應(yīng)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法,之后通過(guò)內(nèi)參法或外參法對(duì)待測(cè)樣品中的特定DNA序列(目的基因)進(jìn)行定量分析的方法。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,這些熒光物質(zhì)可以在激發(fā)光的作用下釋放出一定波長(zhǎng)的發(fā)射光,定量用PCR儀通過(guò)對(duì)這些發(fā)射光進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),較終可以描繪出整個(gè)PCR的反應(yīng)過(guò)程,這就是Real-time PCR的原理。Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng):DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則復(fù)制成同樣的兩分子拷貝。在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,通過(guò)溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,加入設(shè)計(jì)引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。但是,DNA聚合酶在高溫時(shí)會(huì)失活。徐州血液定量PCR供應(yīng)商
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