所謂實時熒光定量PCR技術(shù)，是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán)，利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程，通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。實時熒光定量PCR （Quantitative Real-time PCR）是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中，以熒光化學(xué)物質(zhì)測每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR）循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法?！eal-timePCR是在PCR擴(kuò)增過程中，通過熒光信號，對PCR進(jìn)程進(jìn)行實時檢測。由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時期，模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系，所以成為定量的依據(jù)。qPCR在原有PCR基礎(chǔ)上與熒光檢測方法結(jié)合，實現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍，具有靈敏度高、特異性強的優(yōu)點。佛山Quantagene q225qPCR儀采購

定量首先需要建立Ct值和拷貝數(shù)之間的線性關(guān)系，即標(biāo)準(zhǔn)曲線，標(biāo)曲需要由標(biāo)準(zhǔn)品生成，標(biāo)準(zhǔn)品中基因序列要與待測樣品中基因序列一致，從而保證引物在兩者中擴(kuò)增效率完全相同，標(biāo)準(zhǔn)品來源可以是質(zhì)粒，純化的PCR產(chǎn)物或者基因組DNA等。標(biāo)準(zhǔn)品在加樣時需要注意體積比較好大于2微升，以減少標(biāo)曲誤差，標(biāo)曲是由不同梯度標(biāo)準(zhǔn)品生成，每個標(biāo)準(zhǔn)品梯度建立Ct值與拷貝數(shù)對數(shù)值之間的聯(lián)系，落在標(biāo)曲上的梯度點比較好有5個及以上，至少3個點。標(biāo)準(zhǔn)品和待測樣品同時反應(yīng)，將待測樣品檢測的Ct值代入標(biāo)曲后即可換算出待測樣品中基因的拷貝數(shù)。深圳Quantagene q225qPCR儀消毒q225 加樣孔板側(cè)壁和金屬熱塊能夠嚴(yán)密貼合，使液體樣品迅速達(dá)到設(shè)定溫度，從而減少實驗時間。

傳統(tǒng)定量PCR方法簡介：1）內(nèi)參照法：在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物，內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記，下游引物不標(biāo)記。在模板擴(kuò)增的同時，內(nèi)標(biāo)也被擴(kuò)增。在PCR產(chǎn)物中，由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同，二者的擴(kuò)增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來，分別測定其熒光強度，以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。2）競爭法：選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中，待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴(kuò)增（其中一個引物為熒光標(biāo)記）。擴(kuò)增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物，競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段，而待測模板不被酶切，可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開，分別測定熒光強度，根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。3）PCR－ELISA法：利用地高辛或生物素等標(biāo)記引物，擴(kuò)增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合，再加入抗地高辛或生物素酶標(biāo)抗體－辣根過氧化物酶結(jié)合物，終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR－ELISA法只是定性實驗，若加入內(nèi)標(biāo)，作出標(biāo)準(zhǔn)曲線，也可實現(xiàn)定量檢測目的。

實時熒光定量PCR所使用的熒光物質(zhì)可分為兩種：熒光探針和熒光染料?，F(xiàn)將其原理簡述如下：1. TaqMan熒光探針：PCR擴(kuò)增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針，該探針為一寡核苷酸，兩端分別標(biāo)記一個報告熒光基團(tuán)和一個淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時，報告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收；PCR擴(kuò)增時，Taq酶的5'－3'外切酶活性將探針酶切降解，使報告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離，從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號，即每擴(kuò)增一條DNA鏈，就有一個熒光分子形成，實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。2. SYBR熒光染料：在PCR反應(yīng)體系中，加入過量SYBR熒光染料，SYBR熒光染料非特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后，發(fā)射熒光信號，而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號，從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。SYBR與雙鏈DNA進(jìn)行結(jié)合，因此可以通過溶解曲線，確定PCR反應(yīng)是否特異。3.分子信標(biāo)：是一種在5和3末端自身形成一個8個堿基左右的發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)雙標(biāo)記寡核苷酸探針，兩端的核酸序列互補配對，導(dǎo)致熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)緊緊靠近，不會產(chǎn)生熒光。PCR產(chǎn)物生成后，退火過程中，分子信標(biāo)中間部分與特定DNA序列配對，熒光基因與淬滅基因分離產(chǎn)生熒光。實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限，實現(xiàn)每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度。

檢測原理：將一個樣本分成幾十到幾萬份，再將其分配到不同的反應(yīng)單元中，使每個微滴單元包含一個或多個拷貝的核酸分子（即DNA模板），每個單元都會對目標(biāo)分子進(jìn)行擴(kuò)增，檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號強度，帶入泊松分布即可計算出起始模板DNA濃度。dPCR原理:微滴式數(shù)字PCR檢測流程：其方法與qPCR類似，分為以下幾步。:1、DNA提取2、DNA濃度檢測并稀釋。3、配置PCR反應(yīng)液。4、上機(jī)到PCR儀中進(jìn)行檢測。5、PCR擴(kuò)增。6、結(jié)果判讀。使用微滴數(shù)字PCR儀逐個對每個微滴進(jìn)行檢測，有熒光信號的微滴判讀為1，沒有熒光信號的微滴判讀為0，終根據(jù)泊松分布原理以及陽性微滴的比例，計算出DNA濃度。

dPCR可用于常規(guī)qPCR所需的標(biāo)準(zhǔn)品定量，具有計量學(xué)意義 。廣東qPCR儀

由于qPCR的高靈敏性，陰性對照有出現(xiàn)擴(kuò)增信號的情況，那么在針對這類問題時，我們需要判斷其原因所在。佛山Quantagene q225qPCR儀采購

所有儀器的操作都基本一致。設(shè)置的時候包括反應(yīng)板設(shè)置（plate setup）和程序設(shè)置（program setup）。我們以 ABI StepOne為例，詳細(xì)看一下反應(yīng)設(shè)置：A. 首先是實驗?zāi)康倪x擇：定量還是其他。我們命名為“BioTeke”，進(jìn)行“定量”實驗。B. 實驗方法的選擇：我們選用的比較Ct的SYBR Green方法， Fast程序，以cDNA為模板進(jìn)行。C. 目的基因的設(shè)置：有幾個目的基因和目的基因的名稱。D. 樣品的設(shè)置：包括哪個是實驗組，哪個是對照組。以及負(fù)對照的設(shè)置和生物重復(fù)的設(shè)置。E. 對照組和內(nèi)參基因的設(shè)置：這個是為后面的定量做準(zhǔn)備F. 反應(yīng)程序的設(shè)置：PCR反應(yīng)程序的設(shè)置要根據(jù)不同公司的MasterMix。比如BioTeke的95℃ 2分鐘就可以DNA聚合酶（ABI的需要10 分鐘）。循環(huán)反應(yīng)是95℃15秒，60℃15秒的40個循環(huán)。溶解曲線程序采用儀器默認(rèn)設(shè)置就可以?；蛘呤莾x器說明書上建議的程序。G. 反應(yīng)體系的設(shè)置：A-G這五個步驟簡單設(shè)置好，可以保存，修改反應(yīng)程序或者立刻進(jìn)行反應(yīng)。

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